La cour constitue un vaste espace de 42 mètres de large sur 47 mètres de profondeur fermé par la façade du pronaos et bordé de 3 portiques. Les portiques Est et Ouest sont constitués de 12 colonnes et le portique Sud de 2 fois 4 colonnes avec la porte du pylône en son milieu. Le pylône borde le côté Sud. les murs Est et Ouest font partie du mur d'enceinte qui entourent l'ensemble du temple à partir du pylône. Aux bouts des portiques Ouest et est se trouvent les entrés du corridor formé par le mur d'enceinte et les parois extérieures du pronaos et du naos.
Le côté Est est consacré à la haute Égypte et le côté est à la Basse Égypte. La cour est connue pour présenter les images de la Fête de la Bonne Réunion sur le soubassement Sud. Les parois sont couvertes de scènes de Montée Royale et d'offrandes. Les colonnes portent elles aussi deux scènes d'offrandes. L'ensemble a été décoré sous Ptolémée IX Soter II, même si souvent les cartouches ne portent aucn nom.