La salle hypostyle contient 3 rangées de 6, soit 18 colonnes qui, avec les 6 colonnes engagées de la façade, soutiennent les travées et le plafond.  Elle englobe  la façade du temple ptolémaïque, la dépassant largement. A l'intérieur, la salle mesure environ 16,5 mètres dans le sens Est-Ouest et environ le double dans l'autre sens.
Après la façade, la décoration du plafond et des colonnes fut poursuivie sous différents empereurs : Vespasien, Domitien Trajan, Hadrien et Commode. Puis les noms de Septime Sévére et de ses fils sont inscrits sur les différentes parois.
La vue ci-contre montre à gauche la première rangée de colonnes internes, à partir de la numéro 2 au premier plan. La colonne n°1 se trouve dans l'angle Nord-Est et la n°18 dans l'angle Sud-Ouest.